فیلتر سوخت برای حذف ذرات معلق، آب و ناخالصی‌های موجود در سوخت قبل از ورود آن به سیستم احتراق موتور استفاده‌می‌شود. برخی از ناخالصی‌ها با ورود به سیستم سوخت میتوانند باعث آسیب‌های احتمالی به پمپ سوخت و انژکتور شوند.  این فیلتر به دلیل جلوگیری از ورود ذرات مضر به سیستم سوخت‌رسانی، نقش مهمی در حفظ کارایی موتور ، افزایش راندمان و جلوگیری از خرابی آن دارد. آب می تواند از راه های مختلفی وارد سیستم دیزل شود با سرد شدن سوخت در داخل مخزن، بخار آب در داخل سطوح متراکم می شود و باعث زنگ زدگی یا سایر مشکلات خوردگی می شود. فیلترهای سوخت معمولاً دارای کاغذ فیلتری بسیار ریزبافت هستند که می‌تواند ذرات به کوچکی 2 میکرون را جذب کند.

این فیلتر نیز همانند فیلتر روغن قبل از اینکه گازوئیل وارد موتور شود آن را فیلترمی‌کند. اگر این فیلتر کثیف باشد موتور یا خوب کارنمی‌کند یا اصلا روشن نمی‌شود یا سرعت موتور بازی می‌کند به اصطاح موتور هانت می‌کند.

مشخصات کلیدی این فیلترها شامل کاربرد مورد نظر، فیلتر، اندازه ذرات و سرعت جریان و همچنین ابعاد فیزیکی‌است. فیلترهای سوخت در درجه اول برای فیلترکردن زباله‌ها یا مواد ناخواسته از سوخت استفاده می‌شوند تا از تجهیزات محافظت کنند و همچنین اجازه می‌دهند سوخت به طور موثرتری بسوزد. فیلترها معمولاً برای کاربرد خاصی مانند موتورهای دیزل یا هواپیما و یا برای پرکردن مخازن و غیره طراحی می‌شوند و بسته به کاربرد مورد نیاز در اشکال و اندازه‌های مختلف موجود می‌باشند.